Sekundärstruktur

Die Struktur eines Proteins, die durch Ausbildung intramolekularer Wasserstoffbrücken zwischen den polaren Gruppen des Rückgrates des Proteins, den Peptidbindungen entsteht.

Aufgrund der eingeschränkten freien Drehbarkeit um die C-N-Bindungen der Grundkette (vgl. Primärstruktur) sind in Proteinen nur Rotationen um die C_x-N- bzw. C_y-C-Bindungen möglich.
Diese möglichen Drehungen können durch die Diederwinkel φ und υ beschrieben werden, wobei φ den Winkel der C_x-N-Bindung und υ den der C_y-C-Bindung beschreibt.
Aus sterischen Gründen sind bei einem gegebenen Rest nun nur bestimmte Kombinationen der beiden Winkel möglich.
Bestimmte Kombinationen der Diederwinkel treten in Proteinen mit besonderer Häufigkeit auf.
Nehmen mehrere aufeinanderfolgende Reste eine solche Konformation ein, so bildet sich eines der typischen, geordneten Erscheinungsbilder der Sekundärstruktur.
Die Sekundärstruktur wird durch Wasserstoffbrücken innerhalb der Peptidkette oder zwischen benachbarten Ketten stabilisiert.